Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms