Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms