Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms