Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-21P61565 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms