Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms