Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TfamP40630 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TfamP40630 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TfamP40630 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TfamP40630 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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TfamP40630 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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TfamP40630 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TfamP40630 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TfamP40630 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TfamP40630 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TfamP40630 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TfamP40630 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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