Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1P21675 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1P21675 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1P21675 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1P21675 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1P21675 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1P21675 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1P21675 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1P21675 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1P21675 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1P21675 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1P21675 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1P21675 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1P21675 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms