Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms