Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms