Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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