Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trabd2bB1ATG9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Trabd2bB1ATG9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Trabd2bB1ATG9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Trabd2bB1ATG9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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