Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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