Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms