Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Upk1aQ9D132 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Upk1aQ9D132 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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