Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rpl17Q9CPR4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rpl17Q9CPR4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rpl17Q9CPR4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rpl17Q9CPR4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rpl17Q9CPR4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rpl17Q9CPR4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms