Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms