Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms