Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP350Q5VT06 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms