Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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Rtl5Q5DTT4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Rtl5Q5DTT4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Rtl5Q5DTT4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Rtl5Q5DTT4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Rtl5Q5DTT4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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