Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms