Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.632e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-223ENST00000425601 545 ntTSL 44.64□□□□□ -1.672e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-356ENST00000630206 637 ntTSL 24.57□□□□□ -1.682e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-207ENST00000415222 502 ntTSL 44.33□□□□□ -1.722e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-368ENST00000630985 594 ntTSL 54.26□□□□□ -1.732e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-219ENST00000422515 590 ntTSL 44.2□□□□□ -1.742e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-206ENST00000415060 507 ntTSL 34.14□□□□□ -1.752e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-213ENST00000418564 547 ntTSL 54.07□□□□□ -1.762e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-215ENST00000419963 564 ntTSL 34.07□□□□□ -1.762e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-249ENST00000596573 774 ntTSL 54.06□□□□□ -1.762e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-352ENST00000629825 778 ntTSL 53.99□□□□□ -1.772e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-202ENST00000411429 547 ntTSL 43.91□□□□□ -1.782e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-236ENST00000449178 539 ntTSL 43.91□□□□□ -1.782e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-273ENST00000625227 743 ntTSL 53.91□□□□□ -1.782e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.82e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-338ENST00000629178 517 ntTSL 53.71□□□□□ -1.822e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-274ENST00000625257 648 ntTSL 53.71□□□□□ -1.822e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-225ENST00000432604 569 ntTSL 43.64□□□□□ -1.832e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-235ENST00000444410 478 ntTSL 53.5□□□□□ -1.852e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.872e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-355ENST00000629943 725 ntTSL 53.33□□□□□ -1.882e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-250ENST00000596665 800 ntTSL 53.17□□□□□ -1.92e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-316ENST00000627528 682 ntTSL 43.17□□□□□ -1.92e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-361ENST00000630457 635 ntTSL 53.17□□□□□ -1.92e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-254ENST00000599673 665 ntTSL 52.92□□□□□ -1.942e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-346ENST00000629415 723 ntTSL 52.54□□□□□ -22e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 RHBG-208ENST00000620376 1984 ntTSL 220.85■□□□□ 0.931e-7■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 RHBG-201ENST00000451864 1927 ntTSL 220.63■□□□□ 0.891e-7■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.181e-7■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 RHBG-205ENST00000612897 1862 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.091e-7■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 RHBG-206ENST00000613460 1912 ntTSL 1 (best)13.8□□□□□ -0.21e-7■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 RHBG-207ENST00000618120 2424 ntTSL 212.81□□□□□ -0.361e-7■■□□□ 13.4
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ILF3Q12906 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.211e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 UBE2V2-202ENST00000518360 735 ntTSL 28.23□□□□□ -1.091e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.151e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 UBE2V2-208ENST00000523432 918 ntTSL 26.64□□□□□ -1.351e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 ZNF580-206ENST00000592881 1019 ntTSL 321.2■□□□□ 0.984e-8■■□□□ 13.4
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ILF3Q12906 UQCRH-201ENST00000311672 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.564e-8■■□□□ 13.4
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ILF3Q12906 UQCRH-204ENST00000489056 553 ntTSL 23.86□□□□□ -1.794e-8■■□□□ 13.4
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ILF3Q12906 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.036e-7■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.086e-7■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.296e-7■■□□□ 13.4
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ILF3Q12906 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.041e-8■■□□□ 13.4
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ILF3Q12906 BTF3L4-201ENST00000313334 4703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 BTF3L4-205ENST00000489308 794 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.661e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 BTF3L4-204ENST00000484036 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.711e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 BTF3L4-207ENST00000526132 567 ntTSL 49.25□□□□□ -0.931e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.121e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 BTF3L4-208ENST00000533836 568 ntTSL 44.48□□□□□ -1.691e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.096e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 NFIA-202ENST00000371184 1348 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.576e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 NFIA-210ENST00000479364 1010 ntTSL 511.46□□□□□ -0.576e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.616e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 NFIA-203ENST00000371185 1714 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.796e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -16e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 NFIA-212ENST00000485903 1674 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.056e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.156e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.396e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 NFIA-209ENST00000476646 730 ntTSL 34.48□□□□□ -1.696e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.081e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.021e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 UQCR11-204ENST00000593029 533 ntTSL 219.57■□□□□ 0.721e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 SPATS2-211ENST00000549179 570 ntTSL 422.74■■□□□ 1.232e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 SPATS2-205ENST00000548388 564 ntTSL 217.28■□□□□ 0.362e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■■□□□ 13.4
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