Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms