Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx2P97474 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms