Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms