Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RxrbP28704 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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