Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms