Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms