Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms