Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms