Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms