Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms