Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp27Q8CEG8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp27Q8CEG8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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