Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka5Q8C050 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka5Q8C050 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms