Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms