Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf84Q5VXU9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
C9orf84Q5VXU9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms