Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms