Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM45

Ppp1r7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r7Q3UM45 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r7Q3UM45 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms