Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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