Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLFQ13129 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLFQ13129 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RLFQ13129 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RLFQ13129 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RLFQ13129 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RLFQ13129 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLFQ13129 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLFQ13129 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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