Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms