Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp10P52479 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms