Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC079766.1-201ENST00000608774 427 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC092535.2-201ENST00000513176 1204 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 TEX26-AS1-211ENST00000589840 865 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC132216.1-201ENST00000610375 1158 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CCL7-201ENST00000378569 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PTPN20-222ENST00000509774 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CCDC144NL-AS1-206ENST00000443508 1216 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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