Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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TtrP07309 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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TtrP07309 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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TtrP07309 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtrP07309 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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TtrP07309 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtrP07309 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtrP07309 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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TtrP07309 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtrP07309 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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TtrP07309 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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