Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COBLO75128 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COBLO75128 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COBLO75128 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COBLO75128 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COBLO75128 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COBLO75128 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COBLO75128 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COBLO75128 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms