Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms