Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrit3W8DXL4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrit3W8DXL4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrit3W8DXL4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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