Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afb2S4R1M3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2afb2S4R1M3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afb2S4R1M3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afb2S4R1M3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms