Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt85Q9Z2T6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt85Q9Z2T6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt85Q9Z2T6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt85Q9Z2T6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt85Q9Z2T6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt85Q9Z2T6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt85Q9Z2T6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt85Q9Z2T6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt85Q9Z2T6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt85Q9Z2T6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt85Q9Z2T6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt85Q9Z2T6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt85Q9Z2T6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt85Q9Z2T6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms