Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Robo3Q9Z2I4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Robo3Q9Z2I4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Robo3Q9Z2I4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Robo3Q9Z2I4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Robo3Q9Z2I4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms