Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd2Q9Z2E1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd2Q9Z2E1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms